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非迭代冻结密度近似方法在计算氢键相互作用的合理性研究

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赵明文, 夏曰源, 马玉臣, 刘向东, 英敏菊. 2002: 非迭代冻结密度近似方法在计算氢键相互作用的合理性研究, 物理学报, 51(11): 2440-2445. doi: 10.3321/j.issn:1000-3290.2002.11.007
引用本文: 赵明文, 夏曰源, 马玉臣, 刘向东, 英敏菊. 2002: 非迭代冻结密度近似方法在计算氢键相互作用的合理性研究, 物理学报, 51(11): 2440-2445. doi: 10.3321/j.issn:1000-3290.2002.11.007
shu
2002: The study on hydrogen-bonded systems using frozen density approximation, Acta Physica Sinica, 51(11): 2440-2445. doi: 10.3321/j.issn:1000-3290.2002.11.007
Citation: 2002: The study on hydrogen-bonded systems using frozen density approximation, Acta Physica Sinica, 51(11): 2440-2445. doi: 10.3321/j.issn:1000-3290.2002.11.007
shu

非迭代冻结密度近似方法在计算氢键相互作用的合理性研究

  • 山东大学物理系,济南,250100

  • 山东大学信息技术学院,济南,250100

The study on hydrogen-bonded systems using frozen density approximation

  • 摘要: 为计算相互作用较弱的分子碎片之间的耦合能,Harris 从密度泛函理论出发,提出了一种简化方法,即冻结密度近似(FDA)方法.对该方法在描述分子间氢键作用的合理性进行了验证.对水分子间的HO┉H氢键、甲酰胺与水分子间的NH┉O氢键、二氟甲烷和水分子间的OH┉F氢键,以及DNA中的碱基(AT,GC)之间的N-H┉O,N-H┉N等类型的氢键的计算表明:若电子交换关联采用非定域自旋密度近似,FDA的计算结果同其他ab initio方法的计算结果以及实验结果都符合得很好.FDA在计算过程中既不需要求解泊松方程,也不需要进行反复的自洽迭代,所以运算速度较快,在研究生物大分子体系中的氢键相互作用方面具有一定的使用价值.
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出版历程
  • 刊出日期:  2002-11-30

非迭代冻结密度近似方法在计算氢键相互作用的合理性研究

  • 山东大学物理系,济南,250100
  • 山东大学信息技术学院,济南,250100

摘要: 为计算相互作用较弱的分子碎片之间的耦合能,Harris 从密度泛函理论出发,提出了一种简化方法,即冻结密度近似(FDA)方法.对该方法在描述分子间氢键作用的合理性进行了验证.对水分子间的HO┉H氢键、甲酰胺与水分子间的NH┉O氢键、二氟甲烷和水分子间的OH┉F氢键,以及DNA中的碱基(AT,GC)之间的N-H┉O,N-H┉N等类型的氢键的计算表明:若电子交换关联采用非定域自旋密度近似,FDA的计算结果同其他ab initio方法的计算结果以及实验结果都符合得很好.FDA在计算过程中既不需要求解泊松方程,也不需要进行反复的自洽迭代,所以运算速度较快,在研究生物大分子体系中的氢键相互作用方面具有一定的使用价值.

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