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基于nanoLC-LTQ／OrbitrapMS分析山羊角中蛋白质多肽类物质

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刘睿, 朱振华, 钱大玮, 段金廒. 2017: 基于nanoLC-LTQ／OrbitrapMS分析山羊角中蛋白质多肽类物质, 质谱学报, 38(1): 109-115. doi: 10.7538/zpxb.2017.38.01.0109
引用本文: 刘睿, 朱振华, 钱大玮, 段金廒. 2017: 基于nanoLC-LTQ／OrbitrapMS分析山羊角中蛋白质多肽类物质, 质谱学报, 38(1): 109-115. doi: 10.7538/zpxb.2017.38.01.0109
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2017: Analysis and Identification of Proteins and Peptides f rom Goat Horn (Caprae Hircus Cornu) Using nano LC-LTQ/Orbitrap MS, Journal of Chinese Mass Spectrometry Society, 38(1): 109-115. doi: 10.7538/zpxb.2017.38.01.0109
Citation: 2017: Analysis and Identification of Proteins and Peptides f rom Goat Horn (Caprae Hircus Cornu) Using nano LC-LTQ/Orbitrap MS, Journal of Chinese Mass Spectrometry Society, 38(1): 109-115. doi: 10.7538/zpxb.2017.38.01.0109
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基于nanoLC-LTQ／OrbitrapMS分析山羊角中蛋白质多肽类物质

  • 南京中医药大学，江苏省中药资源产业化过程协同创新中心，中药资源产业化与方剂创新药物国家地方联合工程研究中心，江苏南京 210023; 江苏省海洋药用生物资源研究与开发重点实验室，江苏南京 210023; 江苏省方剂高技术研究重点实验室，江苏南京 210023

  • 南京中医药大学，江苏省中药资源产业化过程协同创新中心，中药资源产业化与方剂创新药物国家地方联合工程研究中心，江苏南京 210023; 江苏省方剂高技术研究重点实验室，江苏南京 210023

Analysis and Identification of Proteins and Peptides f rom Goat Horn (Caprae Hircus Cornu) Using nano LC-LTQ/Orbitrap MS

  • 摘要: 基于shotgun混合蛋白质鉴定思路，研究山羊角水提液中蛋白质类、肽类物质组成。采用超高分辨的线性离子阱‐静电场轨道阱质谱（LTQ／Orbitrap MS），从山羊角水提液中大于3 ku部位鉴定出52个蛋白质，从小于3 ku部位鉴定出1288个肽段，这些肽段源于46个蛋白质。鉴定出的蛋白质主要为角蛋白、胶原蛋白、角蛋白相关蛋白等结构蛋白。根据每个氨基酸出现的频次，将蛋白质上的肽段标记，绘制热图（heat map），据此推测山羊角水提液中多肽类物质形成的过程为：从蛋白质的热区（hot regions）中经过降解、脱落、溶出，形成水提液中的各种肽段。该方法能够快速、高效地分析鉴定山羊角水提液中蛋白质肽类物质组成，可用于角类动物药蛋白质类物质组成与分析，也可为中药动物药的系统研究提供借鉴与方法参考。
    Abstract: The objective of the present study was to study the proteins and peptides of goat horn (Caprae Hircus Cornu ,GH) based on the shotgun strategy .By using LTQ/Orbitrap MS ,proteins and peptides were identified from GH aqueous extract .In total , 52 proteins were identified from GH fraction with the molecular weight larger than 3 ku ,and 1 288 peptides were identified from GH fraction with the molecular weight lower than 3 ku ,and these peptides were hydrolyzed from 46 proteins .The identified proteins were keratin ,collagen ,keratin‐associated protein ,etc .It can be speculated that the particular “hot regions” in the amino acid sequence which were easier to prote‐olysis ,drop , dissolve and generate a number of peptides . According to the present strategy ,proteins and peptides derived from GH aqueous extract can be rapid and efficient identified .The strategy can be applied in analysis and identification of proteins in animal horn derived TCMs ,and provide a reference for investigate the material basis of animal horn derived TCMs .
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出版历程
  • 刊出日期:  2017-02-28

基于nanoLC-LTQ／OrbitrapMS分析山羊角中蛋白质多肽类物质

  • 南京中医药大学，江苏省中药资源产业化过程协同创新中心，中药资源产业化与方剂创新药物国家地方联合工程研究中心，江苏南京 210023; 江苏省海洋药用生物资源研究与开发重点实验室，江苏南京 210023; 江苏省方剂高技术研究重点实验室，江苏南京 210023
  • 南京中医药大学，江苏省中药资源产业化过程协同创新中心，中药资源产业化与方剂创新药物国家地方联合工程研究中心，江苏南京 210023; 江苏省方剂高技术研究重点实验室，江苏南京 210023

摘要: 基于shotgun混合蛋白质鉴定思路，研究山羊角水提液中蛋白质类、肽类物质组成。采用超高分辨的线性离子阱‐静电场轨道阱质谱（LTQ／Orbitrap MS），从山羊角水提液中大于3 ku部位鉴定出52个蛋白质，从小于3 ku部位鉴定出1288个肽段，这些肽段源于46个蛋白质。鉴定出的蛋白质主要为角蛋白、胶原蛋白、角蛋白相关蛋白等结构蛋白。根据每个氨基酸出现的频次，将蛋白质上的肽段标记，绘制热图（heat map），据此推测山羊角水提液中多肽类物质形成的过程为：从蛋白质的热区（hot regions）中经过降解、脱落、溶出，形成水提液中的各种肽段。该方法能够快速、高效地分析鉴定山羊角水提液中蛋白质肽类物质组成，可用于角类动物药蛋白质类物质组成与分析，也可为中药动物药的系统研究提供借鉴与方法参考。

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