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组织中全基因组DNA甲基化的液相色谱-串联质谱分析

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张俊杰, 张立坚, 刘春安, 张良滔, 蔡春. 2010: 组织中全基因组DNA甲基化的液相色谱-串联质谱分析, 质谱学报, 31(6): 326-330.
引用本文: 张俊杰, 张立坚, 刘春安, 张良滔, 蔡春. 2010: 组织中全基因组DNA甲基化的液相色谱-串联质谱分析, 质谱学报, 31(6): 326-330.
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ZHANG Jun-jie, ZHANG Li-jian, LIU Chun-an, ZHANG Liang-tao, CAI Chun. 2010: Analysis of Global DNA Methylation in Tissue by Liquid Chromatography-Tandem Mass Spectrometry, Journal of Chinese Mass Spectrometry Society, 31(6): 326-330.
Citation: ZHANG Jun-jie, ZHANG Li-jian, LIU Chun-an, ZHANG Liang-tao, CAI Chun. 2010: Analysis of Global DNA Methylation in Tissue by Liquid Chromatography-Tandem Mass Spectrometry, Journal of Chinese Mass Spectrometry Society, 31(6): 326-330.
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组织中全基因组DNA甲基化的液相色谱-串联质谱分析

  • 广东医学院,广东湛江,524023

Analysis of Global DNA Methylation in Tissue by Liquid Chromatography-Tandem Mass Spectrometry

  • 摘要: 建立液相色谱-串联质谱测定组织中全基因组DNA甲基化水平的方法.采用苯酚氯仿提取组织DNA,提取的DNA用88%甲酸在140℃下裂解,DNA裂解液加入同位素胞嘧啶作内标,经N2吹干后,用甲醇溶解,以液相色谱-串联质谱检测胞嘧啶和5-甲基胞嘧啶的含量,并计算全基因组中DNA甲基化的水平.结果表明,胞嘧啶的线性范围为1～100μg·L-1,相关系数为0.997 4,相对标准偏差为0.70%～4.09%;5-甲基胞嘧啶的线性范围为1～50μg·L-1,相关系数为0.994 8,相对标准偏差为0.60%～4.81%.胞嘧啶和5-甲基胞嘧啶的检出限为1 Pg,日内相对标准偏差为1.86%～4.67%,日间相对标准偏差为3.72%～4.68%,胞嘧啶和5-甲基胞嘧啶的加样回收率为86.52%～105.14%.本研究所建立的方法检测组织中DNA甲基化程度,具有专一性强、操作简便的优点,能较好的满足全基因组DNA甲基化检测的要求.
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出版历程
  • 刊出日期:  2010-12-28

组织中全基因组DNA甲基化的液相色谱-串联质谱分析

  • 广东医学院,广东湛江,524023

摘要: 建立液相色谱-串联质谱测定组织中全基因组DNA甲基化水平的方法.采用苯酚氯仿提取组织DNA,提取的DNA用88%甲酸在140℃下裂解,DNA裂解液加入同位素胞嘧啶作内标,经N2吹干后,用甲醇溶解,以液相色谱-串联质谱检测胞嘧啶和5-甲基胞嘧啶的含量,并计算全基因组中DNA甲基化的水平.结果表明,胞嘧啶的线性范围为1～100μg·L-1,相关系数为0.997 4,相对标准偏差为0.70%～4.09%;5-甲基胞嘧啶的线性范围为1～50μg·L-1,相关系数为0.994 8,相对标准偏差为0.60%～4.81%.胞嘧啶和5-甲基胞嘧啶的检出限为1 Pg,日内相对标准偏差为1.86%～4.67%,日间相对标准偏差为3.72%～4.68%,胞嘧啶和5-甲基胞嘧啶的加样回收率为86.52%～105.14%.本研究所建立的方法检测组织中DNA甲基化程度,具有专一性强、操作简便的优点,能较好的满足全基因组DNA甲基化检测的要求.

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