单离子束-微流控细胞高通量辐照技术

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詹福如. 单离子束-微流控细胞高通量辐照技术[J]. 强激光与粒子束, 2024, 36(9): 094004-1. doi: 10.11884/HPLPB202436.240023
引用本文: 詹福如. 单离子束-微流控细胞高通量辐照技术[J]. 强激光与粒子束, 2024, 36(9): 094004-1. doi: 10.11884/HPLPB202436.240023
Furu Zhan. High throughput of cell irradiation with microfluidics in single ion microbeam system[J]. High Power Lase and Particle Beams, 2024, 36(9): 094004-1. doi: 10.11884/HPLPB202436.240023
Citation: Furu Zhan. High throughput of cell irradiation with microfluidics in single ion microbeam system[J]. High Power Lase and Particle Beams, 2024, 36(9): 094004-1. doi: 10.11884/HPLPB202436.240023

单离子束-微流控细胞高通量辐照技术

    作者简介: 詹福如,zfr@ipp.ac.cn .
  • 中图分类号: Q337;O657

High throughput of cell irradiation with microfluidics in single ion microbeam system

  • MSC: Q337;O657

  • 摘要: 辐照通量是指单位时间里离子辐照的细胞数量,是单离子束细胞辐照系统的重要性能指标。为提高单离子定位辐照通量,将微流控技术应用于单离子束细胞辐照系统,实现了单离子-单细胞精确定位自动辐照技术。微流控芯片上建立细胞储液池、O2和CO2注入通道、恒温加热、pH检测、细胞检测等功能机构。细胞微流受驱动在通道中保持运动,离子经微流控芯片辐照点射入微通道,对动态细胞进行辐照。基于CAS-LIBB装置,建立离子定位微流细胞的计算模型,研究离子精确瞄准微流细胞的基本方法和规律,获得微流细胞速度、最大辐照通量、辐照剂量、细胞间距等多个参量之间的相互约束关系,成为系统运行的理论指导。提出“即测即打”运行模式,以加快辐照速度,提高离子定位准确性。结果表明,细胞速度和辐照通量均存在上限值,提高微流细胞数密度和离子发射密度,是提高辐照通量的可选方法。采用微流控技术后,辐照通量达到10000细胞/h,相比之前提高10倍以上。计算数据和实验结果基本吻合。
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  • 图 1  单离子束微流控芯片辐照系统

    Figure 1.  Microfluidic chip with single ion microbeam

    图 2  微流控芯片辐照点设计和制作

    Figure 2.  irradiation point on the chip

    图 3  离子定位辐照细胞原理

    Figure 3.  Sketch of the ion aiming at the cells

    图 4  两个离子相继辐照一个运动细胞,准直器固定不动,细胞上两击中点的间距须小于aa为细胞尺度, b为束斑直径

    Figure 4.  Two ions irradiate a cell successively, separation of the two hit points on cell is a, collimator is fixed, b is the beam spot diameter

    图 5  微流通道中单列细胞数密度

    Figure 5.  Number density of the single-row cells in the microfluidic channel

    表 1  设计实例数据

    Table 1.  Data of a design example

    k d/mm n/s−1 m/μL−1 vm/(mm·s−1) Qmax /h−1 Q/h−1 relative error/%
    2 1.0 1000 2500 8.5 30600
    2 1.0 2000 2500 17.0 61200 invalid
    5 1.0 1000 2500 3.4 12240 11861 −3.1
    5 1.0 2000 2500 6.8 24480 23427 −4.3
    10 1.0 1000 2500 1.7 6120 5954 −2.7
    10 1.0 2000 2500 3.4 12240 11775 −3.8
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图( 5) 表( 1)
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出版历程
  • 收稿日期:  2024-01-17
  • 录用日期:  2024-07-23
  • 刊出日期:  2024-09-15

单离子束-微流控细胞高通量辐照技术

    作者简介: 詹福如,zfr@ipp.ac.cn
  • 中国科学院 智能机械研究所,合肥 230031

摘要: 辐照通量是指单位时间里离子辐照的细胞数量,是单离子束细胞辐照系统的重要性能指标。为提高单离子定位辐照通量,将微流控技术应用于单离子束细胞辐照系统,实现了单离子-单细胞精确定位自动辐照技术。微流控芯片上建立细胞储液池、O2和CO2注入通道、恒温加热、pH检测、细胞检测等功能机构。细胞微流受驱动在通道中保持运动,离子经微流控芯片辐照点射入微通道,对动态细胞进行辐照。基于CAS-LIBB装置,建立离子定位微流细胞的计算模型,研究离子精确瞄准微流细胞的基本方法和规律,获得微流细胞速度、最大辐照通量、辐照剂量、细胞间距等多个参量之间的相互约束关系,成为系统运行的理论指导。提出“即测即打”运行模式,以加快辐照速度,提高离子定位准确性。结果表明,细胞速度和辐照通量均存在上限值,提高微流细胞数密度和离子发射密度,是提高辐照通量的可选方法。采用微流控技术后,辐照通量达到10000细胞/h,相比之前提高10倍以上。计算数据和实验结果基本吻合。

English Abstract

  • 单离子束[1-3]是一种能够发射单个离子的束流,具有准确定位目标、精确设定剂量等技术功能,离子定位精度优于5 μm,剂量精度为1个离子的剂量。单离子束在低剂量辐射、空间辐射模拟、染色体基因水平辐射生物机理等研究领域获得了广泛的应用[4-10]。中国科学院智能机械研究所于2004年建成国内首台单离子束系统CAS-LIBB(Chinese Academy of Sciences - the Lab of Ion Beam Biology)[1-2],离子最高能量4 MeV,最优束径3 μm,应用于细胞、线虫、拟南芥等微小样品的辐照研究[11-13]。常规单离子束辐照过程中,需用较多的手工操作,单位时间里辐照的细胞数量(即辐照通量)较低,约1000细胞/h,不能满足基于高通量细胞的生物学研究要求[14-16]。高通量细胞数据具有统计意义,消除了偶然性因素,另外,细胞实验研究中,常常对细胞进行多项检测,需要大量的细胞才能完成研究内容。因此,提高辐照通量是单离子束系统需要解决的重要问题。将微流控技术应用于单离子束辐照装置,是实现高通量辐照技术的主要方法。CAS-LIBB装置上建立微流控技术后,其辐照通量比之前提高一个数量级。目前,单离子束-微流控细胞辐照技术的文献较为鲜见,国际上对单离子束的研究聚焦于精细束径的发展方向,如研制1 μm至亚微米束,甚至纳米束流。Buonanno等人[17]在单离子束装置上采用了微流控,但该系统仅用于辐照线虫而非微流细胞,并且其微通道入口大、出口小,线虫送入微通道后被限定不动,便于离子定位辐照。辐照结束后,线虫被驱动从入口返回出来。本文辐照系统则采用细胞悬液微流体,实行单列细胞微流体连续化辐照技术,提高了辐照通量和效率,实验条件趋于一致和稳定,更能满足生物学研究的要求。单离子束微流控系统中,离子如何瞄准细胞、如何设定细胞运动参数和系统参数,如何获得最大辐照通量,都是重要的基础问题。本文基于CAS-LIBB单离子束微流控系统,对所述问题进行全面的研究和探讨,以期为单离子束微流控辐照技术提供理论指导。

    • 图1所示,系统由单离子束系统和微流控系统两大部分组成。CAS-LIBB单离子束系统包含微米孔准直器、束流开关、粒子探测器、控制系统等关键结构。微流控系统[18-21]由微流控芯片、微流驱动泵及激光探测系统等构成。微流控芯片前端制作细胞储液池,具有O2和CO2注入通道、37 ℃恒温控制、pH检测等功能,以保障细胞成活。驱动泵驱动细胞微流在微通道里匀速流动,将细胞传至离子出射位置,快速完成对细胞的辐照。细胞速度与微流速度同步相等。调节驱动泵可获得不同的细胞速度。激光探测系统用于检测细胞[22-23],总控台根据细胞运动信息来控制离子束流的发射和切断,保证一定数目的离子准确击中细胞。离子束流和准直器均固定不动,微流细胞保持运动。离子从准直器出口发射出来后,经微流控芯片辐照点位置射入微流通道,完成对细胞的辐照。显然,在细胞到达辐照点之前,必须提前检测和识别细胞,系统根据细胞运动信息,计算细胞和离子二者相遇的条件,适时控制束流开关,使离子和细胞同时达到辐照点位置,实现离子精确定位细胞辐照技术过程。

      采用聚二甲基硅氧烷(PDMS)材料制作微流控芯片。与常规微流控芯片不同,辐照用微流控芯片需制作一个辐照点,用于离子进入微流通道的入射点。辐照点是在芯片上制作的一块超薄小区域。经计算和实验确定,对于1~5 MeV质子束,辐照点厚度为10 μm较为合适。过厚会影响离子的穿透性,过薄则易破损,制作难度增大。单离子束垂直向上飞行,故在微通道底部制作辐照点,其水平尺度约30 μm,如图2所示。微流细胞经过辐照点时被离子击中,然后被收集用于生物学研究。

    • 如果细胞静止不动,则只需将细胞移至离子束流出口,随时开通束流,即可完成对细胞的辐照。对于细胞持续运动的情形,须考虑瞄准方法,计算离子和细胞二者相互运动关系,使得细胞抵达辐照点时,离子正好击中细胞。

      建立计算模型如图3所示,细胞运动方向、激光发射方向和离子发射方向三者两两垂直,离子垂直向上飞行,细胞呈水平运动。假定细胞检测点距离辐照点为L,离子从束流开关抵达辐照点的时间为ts,当细胞抵达检测点时被检测,到束流开关产生动作,这个过程系统总响应时间为tx。由于细胞运动速度v远小于离子速度(MeV级质子速度约107 m/s),且束流开关响应时间快(约μs),因此,细胞到达检测点被检测识别后继续前行时,系统则必须等待(延迟)一段时间T,再开通束流开关,才能保证离子和细胞同时到达辐照点。由此可得离子击中细胞的条件是

      理论上只要满足上面的计算式,就能保证离子准确击中细胞。

      细胞速度由驱动泵进行设定和驱动。根据本系统实验条件,最大细胞速度不宜超过10 mm/s,否则容易造成细胞碰撞或黏连,堵塞通道,甚至损坏芯片。故将10 mm/s设定为本系统的细胞速度上限,记为vp。现设定细胞速度v = vp = 10 mm/s,总响应时间为tx=10 μs,离子从开关到达辐照点的时间为ts=0.2 μs,按(1)式计算:$ L=v\times ({t}_{{\mathrm{x}}}+T+ {t}_{{\mathrm{s}}})=0.102\;{\text{μ}}\mathrm{m}+{10}^{4}\;{\text{μ}}\mathrm{m}\times T $/s。

      从上面的计算可以推断,如果不设置延时,即T = 0,则L = 0.102 μm,这说明,即便细胞以最大速度运动,则要求细胞检测点远离辐照点仅仅0.102 μm,这个极小距离相对于系统尺度和细胞大小完全可以忽略。而系统实际运行的细胞速度vvp,上述L的计算值更小,这表明细胞检测点和辐照点极其靠近。因此,本模型将细胞检测点直接设置在辐照点同一位置(或极其接近),即L=0,以省去延时等待的时间T。系统一旦检测到细胞就立即开通束流,则离子就能准确击中细胞。这种忽略的实质是将高速离子的飞行时间近似为0。实际上,这种“即测即打”的方式(L=0,T=0),除了节省了时间外(等待时间T=0),也具有更高的击中可靠性。如果L过大,则细胞在运动过程中,其轨迹和速度难免产生波动,偏离计算值,加大离子瞄准误差。因此,采用“即测即打”方式(L=0,T=0),反而使离子击中细胞的可靠性更高。微流细胞运动速度越小,则细胞之间相互干扰越小,微流更趋稳定一致,所预测离子击打位置的准确性越大。

    • 上述计算只考虑了每个细胞被辐照一个离子剂量的情况。多个离子辐照一个细胞的情况具有很大区别。因细胞保持运动,前后发射的离子击打在细胞上的位置是不同的,后发射的离子击中细胞位置较先发射的离子存在一个偏移。假定每个细胞被辐照k个离子,k>1,系统在单位时间里发射离子数为n(称之为离子发射密度),即相邻两个离子的时间间隔为1/n。当k个离子全部辐照完毕时,其总辐照时间为k/n,细胞此时前行的距离必须小于细胞尺度a,否则离子不能击中细胞,见图4。因此,离子击中细胞的必要条件是

      因此细胞运动速度必须满足

      极限情况下,a取细胞尺度,即得最大细胞速度

      式(5)表明,对于多个离子辐照一个细胞的情况,微流细胞速度存在上限vm,其与细胞尺度a和离子发射密度n相关。设定细胞速度为vm时,系统将获得最大辐照通量。但注意vm始终不得超过vp = 10 mm/s,大于vp则不允许执行。

    • 假定微流细胞之间的平均间距为d,则每辐照一个细胞的时间为

      因此,细胞辐照通量为

      式(7)表明,辐照通量与细胞速度成正比,与细胞间距成反比。(6)和(7)两式与kn无关,是由速度v计算通量的通用公式。

      如果每个细胞只被辐照一个离子剂量,即k=1,则理论上,不管细胞速度多大,都能使离子击中它,但实际系统要求细胞速度vvp =10 mm/s。取v=vp,由式(7)得单个离子剂量的最大辐照通量为

      要实现式(8)中的最大辐照通量,还须要求离子发射密度nQmax,以保证每个细胞均能被辐照一个离子。如果nQmax,则当细胞保持vp前行时,部分细胞未被辐照,此时的有效辐照通量Q′= nQmax。以d = 0.4 mm为例,辐照1个离子剂量时的最大辐照通量为Qmax=25 个细胞/s=90000 个细胞/h,这时要求离子发射密度n≥25个离子/s,实际束流系统n$\gg $25个离子/s,条件总能得到充分的满足。如果每个细胞被辐照多个离子,即k>1,由式(5)和(7)可知,最大辐照通量为

      式(5)和(9)是重要的参量约束公式, 式(5)控制细胞速度上限,式(9)计算最大辐照通量。由式(9)可知,提高辐照通量最简捷的方法是适当提高细胞数密度(即减小d),其次是提高离子发射密度n,但n往往受到束流系统固有性能的制约,提升量有限。减小剂量k也能提高辐照通量,但剂量须满足研究者的要求。

      通过配制细胞液浓度,来确定细胞间距d与细胞数密度m。假定微通道横截面积为S,细胞呈单列行进通过辐照点,如图5所示,若使微流细胞间距为d,则微流细胞数密度m应配成

      式(10)即为悬浮液中细胞间距(平均值)的确定方法。理论上,细胞悬浮液被配置后,其细胞间距与细胞速度无关。据式(10),已知微流细胞数密度为m时,可求平均细胞间距为

    • 每个飞行离子的位置和能量都具有随机的发散性[24-25],因此形成了束斑。束斑直径(束径b)等同于离子定位精度,束径大则定位精度低,反之则高。从图4可知,考虑到束径大小后,如要离子击中细胞,则可允许a值缩小到ab,对照(5)、(9)两式,细胞最大速度和最大辐照通量修正为

      二者数值大小均因此而降低。同样,如果计算的vm值大于vp将视为无效而舍弃。对于单个离子剂量,k=1,最大辐照通量仍由式(8)确定,且与束径大小无关,只要束径小于细胞尺度。其原因是单个离子辐照时,最大细胞速度仍然允许达到vp=10 mm/s,但不能从式(13)外推k=1来求得数据。

    • 离子发射密度n可以具体地理解为每秒发射的离子数目,是决定辐照通量大小的基本因素。如果一个细胞只被辐照一个离子,k=1,则离子发射密度等于细胞辐照通量,由式(7)或(8)确定。此时,离子发射密度不受细胞速度影响,不论细胞速度多大(不超过vp),离子都能击中细胞,只需适时发射离子。

      如果一个细胞被辐照多个离子,k>1,则要求在细胞前行ab的时间里,k个离子必须辐照完毕,即k个离子辐照完毕的时间,不能大于细胞前行(ab)的时间,因此

      由此得

      式(15)显示离子发射密度n与细胞速度v、辐照剂量k密切相关,细胞尺度a和束径b也灵敏地制约离子发射密度。现举例取细胞速度v=5 mm/s,辐照剂量k=8,若a=20 μm, b=3 μm,由式(15)得n2352 个离子/s。该值属单离子系统常规性能条件。通常,束径b的改变量有限,降低细胞速度可使所需的离子发射密度成比例地降低,这是优化实验的主要方法。(8)、(12)、(13)和(15)四式给出了单离子束-微流控系统的额定性能,是系统运行的参考标准。

    • 设计一款微流控芯片,通道截面尺寸为S =30 μm×30 μm,根据式(10)配制细胞悬浮液,使细胞间距约1.0 mm,假定细胞尺度a=20 μm,束径b=3 μm,设定三组离子发射密度和辐照剂量,由(10)、(12)、(13)三式算得几组最大辐照通量如表1所示。

      现对表1中第一行进行说明。从式(13)知,求Qmax时必须先确定细胞间距。要使细胞间距d=1 mm,则由式(10),应将悬浮液细胞数密度配制为2500/μL;由式(12)得最大细胞速度应设为8.5 mm/s;由式(13)得最大辐照通量等于30600 细胞/h。

      上述计算数据表示,在辐照剂量为2个离子、细胞间距为1 mm的条件下,具有以下三种理解:

      (i)当设定细胞速度等于8.5 mm/s,则2个离子均击中细胞,其辐照通量为最大辐照通量;

      (ii)当设定细胞速度小于8.5 mm/s,则2个离子均击中细胞,但辐照通量不是最大值;

      (iii)当设定细胞速度大于8.5 mm/s,则2个离子中至少有1个离子不能击中细胞。

      可见第(i)情形是最优解,故相应的细胞速度称为最大细胞速度。系统运行时,实际的细胞速度不是必须设为最大细胞速度vm,小于vm的速度是安全可行的。

      表1中第二行数据里,计算的细胞速度为17 mm/s,超过了系统允许范围(10 mm/s),因此该组数据不可行而舍弃。由表1可知,多组不同的条件下,辐照通量大都超过10000细胞/h,最高的辐照通量超过30000细胞/h。总体上,高于之前无微流控单离子束辐照通量10倍之多。

      今选取四组辐照通量的实验数据,见表1中实验值,与计算值的相对误差均在5%之内,负值表示实验值低于计算值。误差原因主要是少数细胞的速度小于设置值,一些细胞的运动状态也存在不流畅情形,导致经过检测点的细胞数量小于理论值,因此降低了辐照通量。

    • 将微流控芯片技术应用于离子辐照系统,提升了辐照自动化程度,提高了辐照通量。芯片辐照点的制作是一项新的微流控工艺。将辐照点和细胞检测点置于同一位置,实行“即测即打”的工作模式,压缩了辐照时间,提高了离子定位的准确性。建立了理论模型,获得细胞速度、最大辐照通量与多个系统参量的约束关系。计算表明,对于不同的离子剂量、细胞间距和离子发射密度,存在相应的最大细胞速度vmvmvp);细胞速度等于vm时,可以获得最大辐照通量;提高辐照通量的首选方法是适当提高细胞数密度。计算数据和实验结果基本吻合,二者误差小于5%。

      本系统尚有待发展完善,如辐照点薄层结构的抗压能力较弱,细胞速度受限,影响辐照通量的进一步提高,可以寻求高韧性薄膜嵌入微流控芯片来解决问题;激光光路和显微镜光路各自分立,影响检测灵敏度和工作效率,需研制一体化集成结构;发展1 μm聚焦单离子束,实现基因水平的定位辐照,为研究基因断裂和修复、细胞凋亡等重要课题提供先进的技术平台。本文所建立的模型和计算结果对于单离子束-微流控系统的运行具有普适性的理论指导作用,是离子精准定位微流细胞的基本方法。单离子束-微流控系统提高了自动化程度,在智能化细胞检测技术、在线检测技术、细胞跟踪分析等领域都具有潜在可行的拓展应用。

    参考文献 (25)

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